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                微生物组学Microbial Genomics

                产品简介

                细菌全基因组De novo测序也叫细菌全基因组从头测序,指不依赖于任何参考序列信息就可对某种细菌进行测序,然后用生物信息学的方法进行序列拼接、组装,从而获得该物种的基因组序列图谱,并对其进行结构和功能等一系列的分析。依据研究目标所需精细程度的不同, 我们提供了细菌框架图和细菌完成图两种不同的解决方案。

                产品优势

                • 项目周期短

                  拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台,可以快速拿到高质量测序结果

                • 测序平台齐全

                  拥有多种测序平台,提供最佳的测序解决方案。

                • 分析经验丰富

                  拥有专业的生物信息团队和大型计算机,个性化售后分析服务

                实验流程

                • 样品采集

                • DNA提取检测

                • 文库构建

                • 文库质检

                • 上机测序

                分析流程

                技术参数

                • 测试策略


                  细菌/古菌框架图:HiSeq PE150(350bp文库)

                  细菌/古菌精细图:HiSeq PE250(500bp文库)

                  细菌/古菌完成图:PacBio RS II(10kb SMRT文库)






                • 数据量

                  细菌/古菌框架图:≥100×

                  细菌/古菌精细图:≥100×

                  细菌/古菌完成图:≥50×




                • 周期

                  细菌/古菌框架图:30个工作日

                  细菌/古菌精细图:45个工作日

                  细菌/古菌完成图:60个工作日


                • 指标

                  细菌/古菌框架图:无

                  细菌/古菌精细图:≤30 scaffolds

                  细菌/古菌完成图:1contig,0 Gap