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                环境功能基因组Functional Gene Arrays

                产品简介

                周集中教授及其团队研发于2012年成功研发了微生物群落对环境变化响应的功能基因芯片StressChip,用于检测人工系统和自然生境中环境条件的改变对微生物群落功能组成和功能的影响,进而探讨微生物群落对环境胁迫的响应。
                该芯片针对46个明确的功能基因,共设计了22,855个探针,特异性检测985个细菌、76个古菌和59个真菌物种(或菌株)中79,628个蛋白编码序列,涵盖了微生物对温度、渗透压、氧梯度、营养缺乏等多种环境变化的响应。

                产品优势

                • 有效性高

                  通过对宏基因组数据的计算机验证分析表明,该芯片能清晰反映各胁迫基因在各自生境中的种类和丰度分布,展示了该芯片的有效性

                • 数据可读性强

                  与基于测序的宏基因组数据相比,GeoChip数据简单易懂,可直接用于各类统计分析,有助于结果的解读和比较

                实验流程

                • 样品采集

                • 核酸(DNA/RNA)提取

                • 核酸检测

                • 荧光标记

                • 芯片杂交

                • 芯片扫描与成像

                分析流程

                技术参数

                • 测试策略

                  DNA或cDNA

                  RNA

                • 数据量

                  60K/180K

                  60K/180K

                • 周期

                  55个工作日

                  65个工作日