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                微生物组学Microbial Genomics

                产品简介

                扩增子测序是指利用合适的通用引物扩增环境中微生物的16S rDNA/18S rDNA /ITS高变区或功能基因,通过高通量测序技术检测PCR产物的序列变异和丰度信息,分析该环境下的微生物群落的多样性和分布规律,以揭示环境样品中众多的微生物种类及它们之间的相对丰度和进化关系。

                产品优势

                • 提取经验丰富

                  土壤(农田土壤、森林土壤等);水体(海水、湖泊水、水库水等);活性污泥或底泥(海洋沉积物、AMD底泥、热泉底泥等)等各种环境,数万例样品的提取经验,建立了一系列针对特定环境的手工提取DNA或试剂盒提取DNA的标准方法。

                • 客观真实

                  采用PCR-free建库方式,避免PCR过程的碱基错配,真实还原样本内物种组成信息。

                • 平台最优

                  采用最主流的Illumina HiSeq/Miseq最长测序平台,可以满足16S 1~2个高变区的测序分析,成本更低、通量更大、测序质量和拼接效率更高。

                实验流程

                • 样品准备

                • DNA提取

                • PCR扩增

                • 文库制备及库检

                • 上机测序

                分析流程


                技术参数

                • 测试策略

                  HiSeq2500/Miseq,PE250/PE300

                • 数据量

                  3w/5w/10w 条Tags

                • 周期

                  35个工作日